決勝レースを控えた各クラスのウォームアップ走行が20分ずつ、J-GP3・J-GP2・JSB1000・ST600の順で行われた。
9:10から行われたJSB1000の走行前の気温は14℃と低め、路面温度22℃のコンディションの中、走行が開始された。
走行開始5分で、まずはヤマハ勢の2人、#1 中須賀(Ya,BS)、#4 野左根(Ya,BS)が1-2。
4周目には昨日のレース1で悔しい結果となった#13 高橋(Ho,BS)が48秒台に入る1'48.998でトップへ。
5周目からは多くのライダーがタイムを上げ始める中、好調の#13高橋は1'48.282と一人48秒台前半のタイムで周回。2番手は#1中須賀で1'49.007、3番手に#4野佐根1'49.419。
その後も#13高橋は1'48.071とタイムを更新。ヤマハ勢の2人も48秒台に入り#4野佐根1'48.948、#1中須賀1'48.955。
7周目に#1中須賀が#4野佐根のタイムを上回り2番手へ。#26 渡辺一樹(Su,BS)が1'49.164を記録し4番手に上がってきた。
#13高橋はトップタイムを保持したまま走行は終了。2番手には10周目にタイムを更新した#4野佐根が再び上がり、3番手は前日の勝者で連勝を狙う#1中須賀。4番手に#26渡辺一樹、#090 秋吉(Ho,BS)が1'49.439を記録し5番手となった。
JSBクラス上位の結果は以下の通り。
１：#13 高橋(Ho,BS) 1'48.071
２：#4 野左根(Ya,BS) 1'48.411
３：#1 中須賀(Ya,BS) 1'48.559
４：#26 渡辺一樹(Su,BS) 1'49.164
５：#090 秋吉(Ho,BS) 1'49.186
６：#23 渡辺一馬(Ka,BS) 1'49.782
７：#12 加賀山(Su,BS) 1'50.081
８：#71 津田(Su,DL) 1'51.312
９：#15 Z.ザイディ(Ho,BS) 1'51.553
10：#75 前田(Ya,BS) 1'51.851
